您好，合作协议、款项支付凭证等可以作为证据使用，只要证据充分，建议还是委托律师向法院起诉，主张债权，否则时间长了，债权就无法得到法律保护。即使对方已经申请破产，但是起诉以后，能够确认债权的，债权人还是可以根据债权金额按比例受偿。具体可以咨询律师。如有需要，可与我联系。本律师办公地址：深圳市福田区深南大道4011号香港中旅大厦23层，广东华商律师事务所（全国优秀律师事务所、深圳知名品牌律师事务所），联系电话：18682424878（手机）,0755-83025803（座机）。

需要具体分析对方有没有诈骗的故意，一般情况下生意亏损公安不会立案受理，需要你们通过民事诉讼解决。证据的形式很多种所有能证明你们之间的关系的材料都可以作为证据。破产也有破产还债程序，无论如何想要拿回钱都要先经过法院确认债权才可以。