提问
处理工程纠纷的方法如下：
1、协商：合同当事人在友好的基础上，通过相互协商解决纠纷，这是最佳的方式。
2、调解：合同当事人如果不能协商一致，可以要求有关机构调解。
3、仲裁：合同当事人协商不成，不愿调解的，可根据合同中规定的仲裁条款或双方在纠纷发生后达成的仲裁协议向仲裁机构申请仲裁。
4、诉讼：如果合同中没有订立仲裁条款，事后也没有达成仲裁协议，合同当事人可以将合同纠纷起诉到法院，寻求司法解决。
法律依据
《中华人民共和国民法典》第七百八十九条
【建设工程合同的形式】建设工程合同应当采用书面形式。
《中华人民共和国民法典》第八百零七条
发包人未按照约定支付价款的，承包人可以催告发包人在合理期限内支付价款。发包人逾期不支付的，除根据建设工程的性质不宜折价、拍卖外，承包人可以与发包人协议将该工程折价，也可以请求人民法院将该工程依法拍卖。建设工程的价款就该工程折价或者拍卖的价款优先受偿。
工程纠纷协议书主要包括以下内容：
1、协议双方的信息，包括甲方和乙方的名称、地址、法定代表人或代理人等。
2、协议的背景和原因，说明双方之间存在的工程纠纷以及导致纠纷的原因。
3、纠纷解决方案，详细描述双方达成的纠纷解决方案，包括解除合同、赔偿损失、支付款项等。
4、保密条款，双方同意在协议签订后对协议内容进行保密，避免协议内容泄露给第三方。
5、争议解决方式，双方同意在协议生效后，如果任何一方不履行本协议约定的义务，另一方有权寻求通过诉讼解决争议。
6、其他约定事项，包括双方协商一致的其他条款，例如协议生效时间、协议份数等。
7、签名和盖章，双方代表在协议书上签名并加盖公章，以示认可协议内容。
法律依据
《中华人民共和国民法典》 第四百七十条
合同的内容由当事人约定，一般包括下列条款：
(一)当事人的姓名或者名称和住所;
(二)标的;
(三)数量;
(四)质量;
(五)价款或者报酬;
(六)履行期限、地点和方式;
(七)违约责任;
(八)解决争议的方法。当事人可以参照各类合同的示范文本订立合同。
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