1. 主导机构：根据《民事诉讼法》的规定，法院有权决定是否需要进行司法鉴定，并指定或委托鉴定机构。而在仲裁程序中，虽然仲裁庭也可以决定进行鉴定（《仲裁法》），但更倾向于尊重当事人的选择，鉴定的启动往往需要双方协商一致。

2. 鉴定结果的采信：在民事诉讼中，法院对于鉴定意见有最终决定权，即使当事人对鉴定结果有异议，法院也可根据案情决定是否采纳（《民事诉讼法》第78条）。而在仲裁中，仲裁庭对鉴定结果的采信程度通常更高，除非有明显错误或不公。

3. 证据效力：在诉讼中，鉴定结论是一种重要的证据形式，其效力受法院审查。而在仲裁中，鉴定结论的证据效力往往直接由仲裁庭确定。

1. 程序：民事诉讼遵循的是法定的诉讼程序，包括立案、开庭、判决等步骤，由法院主导。仲裁则通常更为灵活，程序由仲裁庭和当事人协商确定。

2. 决策者：在民事诉讼中，案件的裁决权在于人民法院；而在仲裁中，裁决由独立的仲裁员或仲裁庭作出。

3. 可上诉性：民事诉讼的判决可以向上级法院上诉，除非是终审判决。而仲裁裁决一般是一裁终局，只有在特定情况下（如违反仲裁程序、仲裁员有违法行为等）才能向法院申请撤销。

根据《中华人民共和国仲裁法》和《中华人民共和国民事诉讼法》的规定，当双方当事人在合同或者其他法律关系中有明确的仲裁协议时，应当通过仲裁解决纠纷。一旦选择了仲裁，那么法院将不会受理此类案件，除非仲裁协议无效或者无法执行。反之，如果选择民事诉讼，那么仲裁就不再适用。这是因为仲裁和诉讼遵循“一裁终局”和“一事不再理”的原则，避免了同一纠纷在不同机构重复处理的情况。