医疗事故罪的认定涉及复杂的法律判断，其核心在于明确控方与辩方的证明责任边界。根据中华人民共和国刑法第三百三十五条及司法实践，该罪的证明责任分配遵循控方主导、辩方辅助的原则，既要求公诉机关承担主要举证责任，也允许被告人在特定情形下承担部分举证义务。