股权变更登记是公司法规定的重要程序，涉及到公司的股权结构变动。根据《中华人民共和国公司法》和《公司登记管理条例》，股权变更必须在公司登记机关进行登记，否则变更无效。在这一过程中，需要提交的材料应能充分证明股权变动的事实，如股东的身份证明、公司的章程、股权转让的协议等，同时，所有涉及的变更决定都应经过股东会的合法决议。

1. 主体资格：需要核实目标公司是否合法注册，营业执照是否有效，是否存在被吊销、注销或撤销的情况。

2. 股权结构：调查股东情况、股权比例、股权是否存在质押或冻结等限制情况。

3. 经营合规性：查看公司是否遵守相关法律法规，是否存在重大违法行为，如税务、环保、安全生产等方面的违规记录。

4. 资产权属：确认公司的土地使用权、房产、设备等主要资产的权属清晰，无争议或抵押。

5. 债权债务：了解公司的财务状况，是否存在大额负债，是否有未决诉讼可能影响公司财务状况。

6. 知识产权：检查公司拥有的专利、商标、版权等知识产权的合法性，是否存在侵权或被侵权的情况。

7. 劳动关系：确保公司与员工的劳动合同合规，无重大劳资纠纷。

8. 诉讼仲裁：查询公司是否有未决或历史的重大诉讼、仲裁案件。

股权转让的税务处理主要依据《中华人民共和国个人所得税法》和《中华人民共和国企业所得税法》。对于个人股东，其股权转让所得应按“财产转让所得”项目计征个人所得税，税率为20%。对于企业股东，其股权转让所得或损失并入企业的应纳税所得额，按企业所得税率（一般为25%）计征企业所得税。此外，如果股权转让价格明显偏低，税务机关有权按照公允价值调整计税基础。