商标注册原则如下：
（一）申请在先原则。申请在先原则是指两个或者两个以上的申请人，在同一种商品或者类似商品上，以相同或者近似的商标申请注册的，商标局受理最先提出的商标注册申请，对在后的商标注册申请予以驳回。
（二）自愿注册原则。
（三）使用顺序原则。

法律依据《中华人民共和国商标法》第二十九条

两者是不能替代使用的，它们是有区别的。

第一，保护的对象不同。著作权保护的是供人们欣赏、学习和阅读的作品，如小说等;商标权保护的是用于区别不同生产经营者和不同商品的商品和服务标记。

第二，保护的条件和要求不同。《著作权法》可以保护两部主题相同的作品，只要这些作品具有独创性。但《商标法》不会保护在同一种或同一类商品上的两个相同的商标。

第三，权利产生方式不同。著作权通常自动产生，不必经过任何登记或审查程序;商标则必须依法由国家特定的行政机关进行审查后授予合法申请人。

法律依据《著作权法》第二条、第三条
《中华人民共和国商标法》第三条、第九条