工程尾款超过三年可以起诉，法院会受理，但对方提出时效抗辩的可能败诉。诉讼时效从应付工程款之日起算，没有约定付款时间的，从结算完成或者起诉之日起算。工程尾款一直拖欠，先发书面催告，保留送达凭证，再考虑起诉。工程尾款不给结算，结算条件未成就时，可以直接起诉主张工程款。