保密协议作为保护商业秘密与知识产权的重要法律文件，其违约金赔偿标准的界定以及离职后的补偿问题，直接关系到协议双方的合法权益。明确违约金计算依据与限制条件，厘清离职补偿支付规则，是规避履约风险，保障权益实现的关键。